En esta primera aventura de la franquicia 'Yu-Gi-Oh!' para Nintendo 3DS podrás vivir intensos combates por turnos haciendo uso de los naipes más carismáticos del mundo del anime: las cartas del Duelo de Monstruos. Reúne las casi 5.700 cartas existentes y construye tu propia baraja para hacer frente a un sinfín de contrincantes que se enfrentarán a ti por demostrar quién es el mejor, o combate solo en un juego de cartas sin multijugador. Vive de primera mano la historia ofrecida por 'Yu-Gi-Oh! Zexal', la serie en la que se basa el juego, en un argumento que reúne a sus doce personajes de la serie de animación para vivir historias diferentes con cada uno dependiendo de nuestra elección. El juego originalmente contenía 40 personajes entre los que elegir, todos con una historia y avance diferentes, pero la versión occidental recortó dos tercios de este contenido además de otros modos inexistentes fuera de Japón.
Fue pensado como un manga de terror sobre distintos juegos mortales, pero como el juego de cartas fue muy popular, decidió centrar la serie en Duelo de Monstruos.