Los videojuegos de Mushroom Men fueron desarrollados para Nintendo en las consolas Nintendo DS y Wii. Ambos juegos fueron desarrollados por Red Fly Studio y publicados por Gamecock Media Group. La historia gira en torno a una guerra civil entre hombres hongo de 3 pulgadas de alto (76 mm) en un mundo humano. Según el diseñador del juego Mushroom Men: Rise of the Fungi para Nintendo DS es un juego de plataformas con desplazamiento lateral y una precuela de Mushroom Men: The Spore Wars, la versión para Wii, que es un completo juego de plataformas en 3D. Red Fly Studio utilizó a Gambitious para intentar financiar una secuela, conocida como Pax's Truffle Trouble for PC, que finalmente salió en Steam como Mushroom Men: Truffle Trouble el 10 de marzo de 2015.
La historia comienza cuando un cometa se estrella contra la Tierra, lloviendo un polvo verde extraño a su paso. El polvo espacial es inofensivo para los seres humanos y pasa desapercibido, pero no se dieron cuenta de que la flora, la fauna y los hongos, incluidos hongos, cactus y kudzu ganaron sensibilidad. Además, este extraño polvo verde también mutó algunos de los animales (como conejos, topos, arañas y zarigüeyas). Para sobrevivir, los hongos de nueva conciencia pronto se convirtieron en tribus, y la guerra inevitablemente siguió. La historia de The Spore Wars en Wii también narra la vida del protagonista Pax, un hongo bolete solitario que intenta encontrar su lugar en la sociedad de los hongos. A medida que Pax progresa descubre una lepiota llamada Pester que planea apoderarse del mundo. Pax lo sigue hasta un parque de caravanas donde Pax lucha contra él y hace que caiga al suelo debajo de ellos, dejando que Pester sea asesinado por un perro mutante de hongos que lo devora. Pax regresa a la aldea y se despide de los aldeanos de hongos, diciendo que irá adonde sea que lo lleve el viento.
El juego incluye la construcción de armas, ya que el jugador encuentra objetos cotidianos que se pueden convertir en armas. Por ejemplo, un hacha puede estar hecha de un soporte de mazorca pegado a un palito de helado o incluso de un lápiz táctil de Nintendo DS. Estas armas se dividen en cuatro categorías: acuchillando, golpeando, empujando y radical. Cada categoría de armas tiene sus puntos fuertes en el combate; por ejemplo, un arma acuchillada es excelente cuando es atacada por un grupo de enemigos, mientras que las armas de empuje son útiles para eliminar a los enemigos voladores difíciles de alcanzar.
El tema de los juegos y varias pistas originales fueron compuestos e interpretados por Les Claypool, de Primus, quien contribuyó con pistas originales a la banda sonora del juego, un innovador sistema basado en metrónomos desarrollado por Gl33k, un grupo de música y diseño de sonido ubicado en Austin, TX. Las canciones incluyen "Eye of the Mushroom", "Sidescroll my Heart" y "Opposoumly Dangerous", algunas de las cuales aparecen en el álbum en solitario de Claypool de 2009, Of Fungi and Foe.
2009
