Pese a basarse en las mismas líneas que la historia escrita por Nagatsuki, ''Re:Zero: The Prophecy of the Throne' contará con su propio camino argumental. Lo hará así poniéndonos en la piel de Subaru un mes después de su llegada al nuevo mundo y dentro del arco de La mansión Roswal. Allí, un emisario enviado desde el propio castillo les notificará de que la selección real ha sido aplazada sin una nueva fecha prevista y sin dar más información al respecto sobre ello.
Así Subaru y compañía regresarán a la capital para conocer cúales son los motivos por los que aplazar el gran evento que decidirá el nombre y presencia de la nueva regente del Reino de Lugunica y que servirá como detonante para su acción. Allí encontrarán a una sexta candidata al trono pese a que la profecía habla únicamente de cinco de ellas. Con una de las seis candidatas siendo, claramente, una impostora, las primeras acusaciones caen sobre las espaldas de Emilia. Una trama de mentiras, conspiraciones, traiciones y asesinatos que se darán la mano en un título que da la mano a las novelas visuales y los títulos de estrategia.