'Pokédex 3D' es una aplicación que puede descargarse de manera totalmente gratuita en la eShop de Nintendo 3DS y que permite que te conviertas en todo un entrenador Pokémon, reuniendo los datos de más de 150 Pokémon pertenecientes a las entregas de 'Pokémon Blanco' y 'Pokémon Negro'. Esta app, nos permite disfrutar de modelados 3D de todas las criaturas, y podemos rotar en 360 grados la imagen del Pokémon, así como acercarnos desde distintas perspectivas. A todo esto, también podemos escuchar a cada uno de los Pokémon ahcer su grito característico, así como distintas animaciones. Al mismo tiempo, como no podía ser de otra forma, el juego nos permite realizar búsquedas con distintas alternativas, así como filtrar los Pokémon, por ejemplo por su tipo o tipos. El objetivo del juego consiste en coleccionar las distintas criaturas y, para ello, la aplicación hace uso de las comunicaciones inalámbricas de Nintendo 3DS, como StreetPass, para intercambiar datos con otros jugadores que nos encontremos.