Tercer videojuego de la saga de fútbol con elementos RPG que hacen de cada partido un combate intenso y lleno de energía. Está separado en tres diferentes versiones con diferentes extras e historias que los hacen únicos entre sí: 'Inazuma Eleven 3: Rayo Celeste', 'Inazuma Eleven 3: Fuego Explosivo' e 'Inazuma Eleven 3: La Amenaza del Ogro'.
La trama de esta entrega sitúa a los protagonistas del equipo Raimon en los eventos posteriores a 'Inazuma Eleven 2', tras lo cual pasan a participar en el troneo mundial del Fútbol Frontier Internacional. Esta vez el equipo deberá superarse a sí mismo y convertirse en el mejor equipo de todo el planeta Tierra, y con ello destapar una terrible trama oculta que pretende acabar con el deporte para siempre.
En 'La Amenaza del Ogro' pasamos a contar con más mapas de juego, más capítulos jugables y personajes adicionales que podremos reclutar para crear al equipo de fútbol definitivo. Los dos equipos antagonistas de las versiones anteriores tienen presencia en esta versión.